1、光大银行为财政部开设“财政部零余额账户”，该账户不得提取现金，日终余额为零。
2、光大银行收到财政部提交的《财政直接支付凭证》，经对凭证基本要素审核无误后，通过财政部零余额账户立即办理支付。

属于系统内支付的，通过光大银行对公结算全国一柜通实时将财政资金划拨至收款人账户。

属于同城跨系统支付的，光大银行通过同城票据交换将财政资金于当日划至收款人账户。

属于异地跨系统支付的，光大银行在中国人民银行电子联行系统运行时间内，将资金通过人行电子联行系统划往收款人账户。
3、光大银行办理完支付手续后，将加盖转讫章的《财政直接支付凭证》退回财政部，并与财政部设在人民银行的国库存款账户办理清算。